Z-4195, fourmi ouvrière, est amoureux de la belle princesse Bala. Simple numéro parmi les milliards composant sa colonie il n'a aucune chance d'attirer le regard de la belle. Pourtant il demande l'aide de son meilleur ami, la fourmi soldat Weaver, afin d'approcher l'élue de son coeur. C'est ainsi que par un caprice du hasard, il parasite involontairement le plan machiavélique de l'ambitieux...

Six mois ont passé depuis la dissolution de la Section 9 de la sécurité publique et l'arrestation du cerveau au coeur de l'affaire du rieur. Des terroristes, se faisant appeler "les onze individuels", prennent les employés de l'ambassade de Chine en otage. Motoko Kusanagi et son équipe de lutte contre la cyber-criminalité se trouvent confrontés à un nouveau Stand Alone Complex... Ce film est un...

En 2030, le monde entier est tissé de réseaux électroniques. Une force spéciale d'intervention, la Section 9, a été mise en place par le Ministère de l'Intérieur pour traquer et exterminer la criminalité. La Section 9 enquête sur les agissements d'un hacker appelé "le rieur". Se cachant derrière un smiley naïf, il pirate les cerveaux de ses proies pour les contrôler. Traité comme un criminel...

Nous sommes en 2034. Cela fait 2 ans que Motoko Kusanagi a quitté la Section 9. Togusa est maintenant le nouveau leader d'une équipe dont le nombre a considérablement été revu à la hausse. Cette nouvelle Section 9 affronte à présent une série d'évènements complexes et leur enquête révèle l'implication d'un hacker de classe archi-mage, nommé le Marionnettiste, à la source de tous les accidents....